196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3494 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1337    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  43.78 
 
 
597 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.23 
 
 
630 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.97 
 
 
652 aa  295  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  49.49 
 
 
608 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.59 
 
 
1220 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  26.49 
 
 
1084 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  26.06 
 
 
1090 aa  195  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  25.77 
 
 
1147 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  26.7 
 
 
1075 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.11 
 
 
1021 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
1044 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.54 
 
 
694 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.4 
 
 
1043 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.86 
 
 
1054 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.81 
 
 
1063 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.5 
 
 
1078 aa  170  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.58 
 
 
1041 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.47 
 
 
1082 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.72 
 
 
1060 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.25 
 
 
1048 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.34 
 
 
1032 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.25 
 
 
931 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.38 
 
 
999 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.79 
 
 
1060 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.86 
 
 
1083 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  24.82 
 
 
780 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.82 
 
 
1305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 
757 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.37 
 
 
983 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  30.13 
 
 
337 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.5 
 
 
909 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  31.68 
 
 
661 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  22.7 
 
 
952 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.77 
 
 
371 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0521  heme utilization protein  28.1 
 
 
723 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160365  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.22 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  28.75 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.22 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26.39 
 
 
362 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  27.39 
 
 
357 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  24.82 
 
 
2156 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  27.39 
 
 
357 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  27.39 
 
 
350 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.6 
 
 
371 aa  108  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  24.07 
 
 
373 aa  107  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  27.39 
 
 
357 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.11 
 
 
361 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.17 
 
 
320 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  26.06 
 
 
350 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  25.31 
 
 
370 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.28 
 
 
359 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.74 
 
 
371 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.44 
 
 
385 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  24.68 
 
 
362 aa  98.2  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.43 
 
 
357 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.58 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.26 
 
 
363 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  25.08 
 
 
357 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.09 
 
 
897 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.36 
 
 
357 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.82 
 
 
361 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  94.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  23.81 
 
 
357 aa  94  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.76 
 
 
357 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  24.76 
 
 
357 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  38.46 
 
 
323 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.4 
 
 
357 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  26.56 
 
 
357 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  26.56 
 
 
357 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.74 
 
 
1117 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  26.25 
 
 
361 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  44.96 
 
 
1191 aa  90.9  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.21 
 
 
357 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  30.15 
 
 
409 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.72 
 
 
912 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.7 
 
 
698 aa  87.4  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 
1750 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.58 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  27.64 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  24.13 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  25.87 
 
 
382 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.13 
 
 
371 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  26.25 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  26.25 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  40.15 
 
 
557 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.38 
 
 
742 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  23.74 
 
 
377 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  25.87 
 
 
382 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  26.25 
 
 
404 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  26.25 
 
 
404 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.94 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.05 
 
 
378 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  25.87 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>