121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3424 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  56.27 
 
 
361 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.83 
 
 
359 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  52.73 
 
 
366 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  53.72 
 
 
368 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  52.92 
 
 
377 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  50.13 
 
 
367 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.96 
 
 
361 aa  302  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.57 
 
 
371 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  43.63 
 
 
373 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  42.66 
 
 
371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  39.4 
 
 
371 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  44.17 
 
 
362 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.4 
 
 
393 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.51 
 
 
381 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  39.78 
 
 
367 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  38.9 
 
 
371 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.95 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.38 
 
 
383 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  36.69 
 
 
382 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  35.82 
 
 
382 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  35.31 
 
 
404 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  35.31 
 
 
404 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  35.66 
 
 
382 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  34.7 
 
 
371 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  35.34 
 
 
377 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.12 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  36 
 
 
368 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  35.11 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  35.44 
 
 
369 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  34.79 
 
 
382 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  35.16 
 
 
377 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  34.99 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  34.7 
 
 
365 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  35.22 
 
 
365 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  35.83 
 
 
365 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.59 
 
 
385 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.68 
 
 
681 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  29.69 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  26.04 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  26.15 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.77 
 
 
357 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.77 
 
 
357 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  25.66 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  25.28 
 
 
357 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.6 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  29.72 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.41 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.41 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.89 
 
 
630 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.41 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.41 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  29.11 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.62 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.02 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.66 
 
 
652 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.02 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 
357 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  31.48 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.91 
 
 
1220 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  25.3 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.13 
 
 
608 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  31.63 
 
 
1090 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  26.74 
 
 
1054 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.51 
 
 
597 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.21 
 
 
931 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25 
 
 
1082 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.49 
 
 
1041 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.67 
 
 
757 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.15 
 
 
1043 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  33.85 
 
 
952 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1078 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.72 
 
 
694 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.62 
 
 
999 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25 
 
 
1048 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.79 
 
 
1021 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.3 
 
 
1063 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.17 
 
 
1083 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.85 
 
 
780 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.4 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.2 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  26.27 
 
 
1084 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  23.53 
 
 
873 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.17 
 
 
1060 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.98 
 
 
1044 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  23.1 
 
 
698 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  28.16 
 
 
934 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>