124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4987 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 393 aa  804    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.47 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  62.8 
 
 		 378 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  41.08 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.43 
 
 		 361 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  41.4 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  41.08 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  39.84 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  36.75 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  38.2 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  39.84 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  32.89 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.54 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  37.63 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  38.38 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  37.37 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  35.46 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  35.71 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  37.3 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  34.34 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  34.34 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.77 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  34.66 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  35.88 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  35.88 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  34.95 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  35.2 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  35.01 
 
 		 385 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  34.88 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.43 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.36 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  35.12 
 
 		 369 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  35.19 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  35.42 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  35.09 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  35.37 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.58 
 
 		 681 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.53 
 
 		 608 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.05 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.06 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.78 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.34 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.62 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  21.2 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.44 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  21.2 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  21.69 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  21.69 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.06 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.06 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  26.85 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  23.56 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.65 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  27.83 
 
 		 1084 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1082 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  22.16 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.96 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  23.32 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  22.52 
 
 		 912 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.82 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1044 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1078 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 999 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.16 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.17 
 
 		 694 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  23.43 
 
 		 942 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1147 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 931 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  25 
 
 		 906 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  26.04 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 983 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.92 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  23.08 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  21.32 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1075 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1060 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.36 
 
 		 707 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1117 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  25.34 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1090 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1063 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  23.83 
 
 		 1288 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 1021 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>