99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0669 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  100 
 
 
780 aa  1575    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  71.7 
 
 
909 aa  1060    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  49.28 
 
 
757 aa  698    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.61 
 
 
630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.56 
 
 
681 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.85 
 
 
652 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.21 
 
 
1220 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.02 
 
 
608 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.24 
 
 
931 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  21.83 
 
 
1032 aa  76.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  27.34 
 
 
1048 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.06 
 
 
1063 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.43 
 
 
1021 aa  74.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.85 
 
 
694 aa  74.3  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26 
 
 
1044 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 
999 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  26.24 
 
 
1054 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.26 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  27.22 
 
 
1090 aa  67.8  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  28.02 
 
 
1084 aa  67.4  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  22 
 
 
1147 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.53 
 
 
1082 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  25.71 
 
 
373 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  24.36 
 
 
1075 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.79 
 
 
1060 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  29 
 
 
362 aa  61.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  21.98 
 
 
1043 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.5 
 
 
1041 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  25.9 
 
 
371 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  22.89 
 
 
371 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.79 
 
 
1060 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.22 
 
 
324 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  20.37 
 
 
897 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.94 
 
 
385 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.25 
 
 
345 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.25 
 
 
345 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.49 
 
 
1078 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.87 
 
 
371 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.82 
 
 
983 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  21.07 
 
 
912 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.82 
 
 
363 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  25.34 
 
 
371 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  25.78 
 
 
363 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  27.85 
 
 
362 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  26.02 
 
 
365 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  26.46 
 
 
931 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.29 
 
 
707 aa  52.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  26.11 
 
 
368 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  27.46 
 
 
323 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.51 
 
 
378 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  30.77 
 
 
409 aa  51.2  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  23.34 
 
 
661 aa  51.2  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.57 
 
 
359 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  25 
 
 
1083 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.67 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  29.37 
 
 
934 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.11 
 
 
842 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  29.73 
 
 
337 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  28.88 
 
 
365 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25 
 
 
742 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  23.31 
 
 
343 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  25.76 
 
 
324 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.23 
 
 
931 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  19.74 
 
 
876 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.38 
 
 
361 aa  47.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  25.24 
 
 
403 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31.97 
 
 
1117 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  25.82 
 
 
925 aa  47.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  22.7 
 
 
1904 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  26.99 
 
 
357 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  24.5 
 
 
382 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  24.7 
 
 
382 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  25.97 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  26.98 
 
 
341 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  24.08 
 
 
404 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  24.08 
 
 
404 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.23 
 
 
366 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.74 
 
 
1465 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.76 
 
 
319 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  26.64 
 
 
527 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  26.91 
 
 
698 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.89 
 
 
383 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.24 
 
 
329 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1515  hypothetical protein  26.74 
 
 
421 aa  45.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.18 
 
 
1750 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  26.76 
 
 
346 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  31.5 
 
 
334 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.6 
 
 
310 aa  44.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  25.93 
 
 
787 aa  44.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  25.91 
 
 
279 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  31.5 
 
 
334 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  30.65 
 
 
942 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  24.03 
 
 
357 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  24.03 
 
 
357 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  20.32 
 
 
952 aa  44.3  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.09 
 
 
361 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3196  hypothetical protein  29.02 
 
 
204 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102103  normal  0.212274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  29.41 
 
 
320 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>