194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2465 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1171    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  49.49 
 
 
681 aa  273  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.48 
 
 
630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.28 
 
 
652 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  38.49 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.91 
 
 
726 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.06 
 
 
694 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  28.48 
 
 
362 aa  110  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.81 
 
 
361 aa  104  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  26.83 
 
 
1220 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  25.33 
 
 
1305 aa  97.4  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.53 
 
 
757 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  40 
 
 
2117 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.02 
 
 
345 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.02 
 
 
345 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  28.19 
 
 
1084 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  37.59 
 
 
514 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.6 
 
 
371 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  26.18 
 
 
337 aa  90.1  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  28.19 
 
 
1054 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  28.89 
 
 
1032 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  28.24 
 
 
1147 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  36.17 
 
 
331 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.27 
 
 
1078 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  31.2 
 
 
1083 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.53 
 
 
393 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  25.97 
 
 
1075 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.55 
 
 
371 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.32 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  24.5 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  25.68 
 
 
377 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  27.27 
 
 
1043 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  28.02 
 
 
780 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.29 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  35.83 
 
 
835 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  24.5 
 
 
1090 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 
931 aa  81.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.83 
 
 
909 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.26 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1021 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.26 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  28.98 
 
 
1060 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  41.23 
 
 
1303 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.42 
 
 
1041 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.04 
 
 
1044 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  28.37 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  26.12 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  26.12 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40.54 
 
 
1035 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 
2082 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.11 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.03 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  39.55 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  22.97 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  26.2 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.79 
 
 
357 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.59 
 
 
1082 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.26 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25.2 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  37.59 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.9 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  26.14 
 
 
1048 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31.72 
 
 
1117 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.21 
 
 
999 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  28.05 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  25.53 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  24.36 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.83 
 
 
357 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  22.82 
 
 
371 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.63 
 
 
371 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  22.9 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  23.95 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  26.91 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1063 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.51 
 
 
357 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.9 
 
 
385 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  25.2 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  26.34 
 
 
370 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  35.62 
 
 
1081 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.93 
 
 
661 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  23.13 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.39 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  25.9 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  25.9 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  43.84 
 
 
826 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  26.51 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  26.51 
 
 
385 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  24.83 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.59 
 
 
1060 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  31.2 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.88 
 
 
1191 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>