213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1547 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 630 aa  1242    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  79.15 
 
 		 652 aa  938    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 681 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  42.48 
 
 		 608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  28.95 
 
 		 597 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.97 
 
 		 694 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.69 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1063 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1220 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 757 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1082 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.65 
 
 		 1084 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 999 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1078 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1054 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.01 
 
 		 345 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.01 
 
 		 345 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1090 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1044 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  27.8 
 
 		 1305 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  26.11 
 
 		 1083 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.87 
 
 		 909 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1147 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1060 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1048 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 983 aa  107  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 931 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1043 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1021 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1032 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1075 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.57 
 
 		 1041 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  32.54 
 
 		 362 aa  96.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1060 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  26.86 
 
 		 373 aa  94.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  27.04 
 
 		 371 aa  94  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 371 aa  90.9  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.59 
 
 		 361 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.16 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  26.99 
 
 		 371 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.4 
 
 		 363 aa  87  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.8 
 
 		 359 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  31.89 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1117 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  22.79 
 
 		 952 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.71 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  26.86 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.36 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.36 
 
 		 742 aa  77  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.5 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.51 
 
 		 357 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  27.95 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.14 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.06 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  26.32 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.34 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.26 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  43.85 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  21.5 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.79 
 
 		 357 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  24.26 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.85 
 
 		 357 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  29.45 
 
 		 934 aa  70.5  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.32 
 
 		 357 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1273  hypothetical protein  34.71 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.67 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3247  hypothetical protein  34.71 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.66 
 
 		 842 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1191 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  31.14 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.55 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.7 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  23.51 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  29.71 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  33.62 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.08 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.51 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  26.48 
 
 		 925 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.74 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  28.85 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.07 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.6 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  21.47 
 
 		 876 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1026 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>