112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06820 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  863    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.23 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.94 
 
 		 897 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1021 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  26.2 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  27.6 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.65 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  26.97 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.25 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.25 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.97 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  29.93 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.92 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  33.33 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.93 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  27.69 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  21.79 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  23.67 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  33.06 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.06 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  26.4 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  28 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.51 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  26.1 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  26.1 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.5 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  28 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.71 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  29.14 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25.43 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  28.08 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  32.04 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 338 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1060 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  24 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  25.7 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 931 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.98 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1032 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.78 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.11 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  34.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.16 
 
 		 321 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  25.7 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.27 
 
 		 342 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  24.53 
 
 		 337 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  27.07 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  25.3 
 
 		 341 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  24.02 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.84 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.23 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1078 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5366  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0389017  hitchhiker  0.000000428004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  25.2 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.81 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  27.97 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1054 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1117 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.34 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  25.29 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  25.84 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  23.18 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  28 
 
 		 1075 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1044 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  27.67 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.47 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 999 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  24.67 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1082 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1063 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  25.81 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  24.2 
 
 		 1084 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  27.56 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1048 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  30.12 
 
 		 1527 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 757 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  27.16 
 
 		 902 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2745  hypothetical protein  32.94 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  24.4 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1060 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3022  hypothetical protein  32.94 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1043 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>