107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2440 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  57.68 
 
 
371 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  59.08 
 
 
368 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  59.38 
 
 
365 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  57.62 
 
 
385 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  57.81 
 
 
382 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  57.03 
 
 
404 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  57.03 
 
 
404 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  56.51 
 
 
382 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  56.77 
 
 
382 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  56.14 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  54.36 
 
 
388 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  54.36 
 
 
388 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  56.2 
 
 
377 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  59.29 
 
 
365 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  55.92 
 
 
365 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.56 
 
 
361 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  56.18 
 
 
381 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  56.79 
 
 
377 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  53.87 
 
 
369 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  55.31 
 
 
371 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  56.46 
 
 
367 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.2 
 
 
359 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  37.17 
 
 
361 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.42 
 
 
393 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.47 
 
 
378 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.73 
 
 
383 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  34.99 
 
 
362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  35.92 
 
 
362 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.24 
 
 
361 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.69 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.66 
 
 
367 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  31.42 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  34.52 
 
 
373 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  30.27 
 
 
371 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  31.79 
 
 
371 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  30.79 
 
 
368 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.08 
 
 
385 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  24.38 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  24.72 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.96 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.96 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.35 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  23.46 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  23.4 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.86 
 
 
608 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  26.87 
 
 
1048 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.6 
 
 
597 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.63 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.91 
 
 
681 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  30.31 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 
630 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.04 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.04 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.31 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  22.25 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  21.98 
 
 
357 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  22.04 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.45 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  28.12 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.75 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.21 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.13 
 
 
1078 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.31 
 
 
757 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  26.07 
 
 
1060 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  20.83 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  22.15 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.18 
 
 
931 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.17 
 
 
694 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.05 
 
 
1060 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  25.91 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25.81 
 
 
1054 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1063 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  26.92 
 
 
1117 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  30.29 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  25.23 
 
 
1147 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.45 
 
 
1041 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.32 
 
 
1044 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  22.96 
 
 
1090 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.02 
 
 
909 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.03 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.02 
 
 
1043 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  26.09 
 
 
1084 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.52 
 
 
1082 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1052  hypothetical protein  26.41 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.52 
 
 
912 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.77 
 
 
1075 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  22.9 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.63 
 
 
983 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2010  hypothetical protein  25.71 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785171  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.57 
 
 
1220 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>