134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03670 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.49 
 
 		 1078 aa  880    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.89 
 
 		 1063 aa  895    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1048 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1043 aa  863    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  57.06 
 
 		 1044 aa  1206    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  41.44 
 
 		 1060 aa  851    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 1021 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.44 
 
 		 1082 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  53.39 
 
 		 1060 aa  1142    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  44.05 
 
 		 931 aa  788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  100 
 
 		 1032 aa  2138    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 999 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.66 
 
 		 1041 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1054 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  32.62 
 
 		 1084 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1147 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1090 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 983 aa  356  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  34.44 
 
 		 952 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.34 
 
 		 681 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1220 aa  161  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  26.99 
 
 		 912 aa  147  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.87 
 
 		 652 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.23 
 
 		 630 aa  104  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  21.38 
 
 		 1083 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1117 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.89 
 
 		 608 aa  89.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.3 
 
 		 694 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  21.83 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  26.25 
 
 		 931 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.75 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.62 
 
 		 909 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  24.74 
 
 		 931 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1321 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.86 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  25.73 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  23.42 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.82 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26.17 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.78 
 
 		 357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  25.98 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.53 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.09 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  21.48 
 
 		 1305 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.24 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  25.38 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  25.34 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  24.42 
 
 		 1750 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  26.59 
 
 		 488 aa  57.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.45 
 
 		 359 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  26.14 
 
 		 479 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 371 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  20.69 
 
 		 357 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  24.64 
 
 		 464 aa  55.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  26.05 
 
 		 906 aa  55.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1191 aa  54.7  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.2 
 
 		 361 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.51 
 
 		 363 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  24.12 
 
 		 357 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.46 
 
 		 320 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  22.58 
 
 		 388 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  22.58 
 
 		 388 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  25.7 
 
 		 357 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  23.4 
 
 		 362 aa  52.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  24.12 
 
 		 876 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.31 
 
 		 312 aa  52.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.88 
 
 		 842 aa  52  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  23.2 
 
 		 371 aa  52.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  20.49 
 
 		 357 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  52  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  27.36 
 
 		 935 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  23.32 
 
 		 367 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 350 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  25.12 
 
 		 357 aa  52  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  26.17 
 
 		 913 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  23.25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  50.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  24.81 
 
 		 343 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.4 
 
 		 305 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.49 
 
 		 310 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  27.39 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  21.64 
 
 		 357 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  31.13 
 
 		 409 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  27.17 
 
 		 925 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>