49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0625 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
305 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  83.88 
 
 
312 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  41.91 
 
 
281 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  41.49 
 
 
281 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  40.25 
 
 
281 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  39.86 
 
 
282 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  38.27 
 
 
279 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  38.27 
 
 
279 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  40.84 
 
 
310 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.18 
 
 
296 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.71 
 
 
288 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  38.96 
 
 
303 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  33.74 
 
 
296 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  33.74 
 
 
296 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  33.74 
 
 
296 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  37.6 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  37.19 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  30.23 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  30.23 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  26.15 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.95 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  29.89 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  29.94 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  25.1 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  29.94 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  29.94 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  29.94 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.68 
 
 
322 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.24 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  33.33 
 
 
661 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.7 
 
 
630 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  29.69 
 
 
681 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.86 
 
 
597 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.32 
 
 
652 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  36.36 
 
 
742 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  27.4 
 
 
1032 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.85 
 
 
3794 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 
1465 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.88 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  23.83 
 
 
698 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31.05 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1754  hypothetical protein  34.58 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.57 
 
 
897 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  29.52 
 
 
363 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  24.31 
 
 
1288 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30 
 
 
909 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.18 
 
 
1048 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>