111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04767 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  785    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  785    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  84.28 
 
 		 377 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  82.47 
 
 		 382 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  81.96 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  80.67 
 
 		 382 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  80.41 
 
 		 382 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  79.12 
 
 		 404 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  79.12 
 
 		 404 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  81.96 
 
 		 385 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  64.08 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  61.76 
 
 		 365 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  59.02 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.22 
 
 		 381 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  54.69 
 
 		 365 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  55.13 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.27 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  56.7 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  55.93 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  51.82 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  52.34 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  52.62 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.75 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.49 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.01 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.34 
 
 		 378 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.42 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  33.42 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  33.84 
 
 		 361 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  33.84 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  33.16 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  32.73 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.73 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  29.92 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  32.4 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  32.13 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.55 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.62 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.3 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25.9 
 
 		 608 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1060 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1048 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  26.74 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1060 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.85 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  24.49 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1090 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.5 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.5 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.25 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  25.58 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  21.96 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1078 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1147 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.76 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.76 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.62 
 
 		 630 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.63 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.74 
 
 		 652 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  21.28 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.25 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1054 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  24.63 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  21.21 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.51 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  20.88 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1032 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  19.93 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  19.93 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.31 
 
 		 698 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.78 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1044 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1082 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.25 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1043 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 999 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  21.77 
 
 		 1084 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.39 
 
 		 1041 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1063 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  21.43 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  26.06 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.65 
 
 		 694 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 983 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  25.48 
 
 		 942 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  27.15 
 
 		 925 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23 
 
 		 757 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  24.87 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>