48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3069 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
312 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  83.88 
 
 
305 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  39.03 
 
 
281 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  39.41 
 
 
281 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  39.83 
 
 
281 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  40.73 
 
 
282 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  35.9 
 
 
279 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  35.9 
 
 
279 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  42.53 
 
 
296 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  42.39 
 
 
310 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.24 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  36.48 
 
 
296 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  36.48 
 
 
296 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  36.48 
 
 
296 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  38.4 
 
 
303 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  34.85 
 
 
288 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  36.68 
 
 
288 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  30.92 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  30.64 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  30.11 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  30.11 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.94 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  29.48 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  29.48 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  29.48 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  29.48 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  29.48 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  29.48 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.6 
 
 
630 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.76 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.83 
 
 
652 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.89 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  29.47 
 
 
681 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.89 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  31.15 
 
 
661 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  28.31 
 
 
1032 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  33.85 
 
 
742 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1754  hypothetical protein  29.75 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.46 
 
 
3794 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.84 
 
 
1060 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.1 
 
 
363 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.94 
 
 
698 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  25 
 
 
952 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.87 
 
 
614 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.47 
 
 
597 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
1465 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.52 
 
 
931 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.64 
 
 
1021 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>