46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4591 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
310 aa  607  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  53.92 
 
 
296 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  44.16 
 
 
303 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  48.56 
 
 
296 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  48.56 
 
 
296 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  48.56 
 
 
296 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  48.51 
 
 
288 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  48.51 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  43.44 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  39.59 
 
 
279 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  39.59 
 
 
279 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  38.78 
 
 
281 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  38.37 
 
 
281 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.84 
 
 
305 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  38.78 
 
 
281 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.39 
 
 
312 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.87 
 
 
288 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  35.94 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  27.66 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  27.66 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.12 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  27.23 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  26.91 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  26.91 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  27.23 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  27.23 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.75 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  26.52 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.94 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.05 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  30.37 
 
 
661 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.39 
 
 
329 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.85 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.09 
 
 
1032 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1060 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  28.15 
 
 
403 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  30.21 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  28.37 
 
 
1220 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.9 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  30.21 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.64 
 
 
897 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  26.83 
 
 
698 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  30.69 
 
 
350 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.49 
 
 
366 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>