43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1726 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 
325 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  41.95 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  41.99 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  41.69 
 
 
327 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  41.69 
 
 
327 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  41.96 
 
 
334 aa  278  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  41.96 
 
 
334 aa  278  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  41.16 
 
 
330 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  41.39 
 
 
327 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  42.38 
 
 
323 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.67 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.3 
 
 
303 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.62 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  35.43 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  35.43 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  35.43 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  26.75 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  31.79 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  27.23 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  31.79 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.09 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  24.37 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  25.5 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  26.81 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  24.9 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  27.94 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.94 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.32 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.95 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  27.56 
 
 
258 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.67 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.15 
 
 
1044 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.64 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.64 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  34.38 
 
 
1220 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  21.51 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  26.17 
 
 
1043 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.61 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.58 
 
 
681 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  27.33 
 
 
597 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.92 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.42 
 
 
707 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>