33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1454 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  74.02 
 
 
281 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  73.31 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  71.89 
 
 
281 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  49.64 
 
 
282 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.6 
 
 
288 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.9 
 
 
312 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.27 
 
 
305 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  39.59 
 
 
310 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  39.08 
 
 
296 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  36.16 
 
 
296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  36.16 
 
 
296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  36.16 
 
 
296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  36.95 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  36.29 
 
 
288 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  37.96 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  36.71 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.05 
 
 
303 aa  85.5  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  27.88 
 
 
327 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  27.88 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  27.88 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  27.88 
 
 
327 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  27.88 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  31.4 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.79 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  31.4 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  26.72 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  28.87 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.72 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.48 
 
 
630 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.21 
 
 
652 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>