54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4193 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  57.04 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  48.56 
 
 
310 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.99 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  43.51 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  43.51 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.96 
 
 
288 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  35.42 
 
 
281 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  36 
 
 
279 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  36 
 
 
279 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  33.22 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  34.11 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.25 
 
 
312 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  32.62 
 
 
281 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.65 
 
 
305 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.87 
 
 
303 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.41 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  27.89 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  27.89 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  28.23 
 
 
323 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  27.89 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  31.17 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  29.82 
 
 
327 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  36.42 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  36.42 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  32.21 
 
 
330 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.47 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.57 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.09 
 
 
652 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.22 
 
 
630 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.6 
 
 
597 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  31.36 
 
 
742 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.71 
 
 
661 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.2 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.58 
 
 
1147 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  27.47 
 
 
1043 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.65 
 
 
1220 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  32.88 
 
 
698 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.57 
 
 
1021 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  27.84 
 
 
681 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  27.22 
 
 
912 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.78 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  35.24 
 
 
1026 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.95 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  26.6 
 
 
527 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  34.69 
 
 
1117 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27 
 
 
999 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1060 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  23.71 
 
 
1032 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
694 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  27.16 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>