39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0890 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  90.04 
 
 
281 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  81.14 
 
 
281 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  74.02 
 
 
279 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  74.02 
 
 
279 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  52.38 
 
 
282 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.03 
 
 
312 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.49 
 
 
305 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.42 
 
 
288 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.37 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  37.65 
 
 
296 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  34.24 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  34.24 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  34.24 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  34.6 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  34.83 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  35.1 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.62 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.75 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.24 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  30.23 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  29.57 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  30.23 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  29.57 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  29.57 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  29.57 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  26.74 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  29.57 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  29.57 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.41 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.94 
 
 
630 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  30.1 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.74 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  28.22 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.27 
 
 
652 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.79 
 
 
661 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  27.72 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>