45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1610 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  91.75 
 
 		 303 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  38.66 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  38.66 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  39.85 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  38.29 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  38.29 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  38.29 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  38.29 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  36.75 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  35.68 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  30.05 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  30.05 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  29.46 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.06 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.57 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  30.62 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  31.82 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  29.46 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.75 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  34.29 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  30.41 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.98 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.87 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.53 
 
 		 630 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.89 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.68 
 
 		 652 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.4 
 
 		 1305 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.82 
 
 		 909 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  32.67 
 
 		 780 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.7 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.7 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  21.78 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.4 
 
 		 597 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1082 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 999 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1075 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1044 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>