35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4247 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  39.07 
 
 
282 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  34.98 
 
 
281 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  34.22 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  36.71 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  36.71 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  34.98 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  39.8 
 
 
303 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.94 
 
 
310 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  39.72 
 
 
288 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  37.07 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  40.5 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  32.91 
 
 
296 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  32.91 
 
 
296 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  32.91 
 
 
296 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
305 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.02 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.92 
 
 
312 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  24.69 
 
 
334 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  24.69 
 
 
334 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  27.51 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.56 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  25.97 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  25.97 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  25.97 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  28.02 
 
 
330 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  25.22 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  25.22 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.63 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.4 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  29.84 
 
 
350 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  29.51 
 
 
897 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  28.48 
 
 
370 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>