103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0399 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  100 
 
 
335 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  80.87 
 
 
350 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  76.58 
 
 
315 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  39.06 
 
 
314 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  28.98 
 
 
661 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  29.9 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.55 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  34.39 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.57 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.69 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.87 
 
 
897 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.23 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.23 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.77 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  30.89 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  31.71 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.21 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  30.59 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.91 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  30.59 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.44 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.76 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.91 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.91 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  31.71 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  30.77 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.1 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  29.21 
 
 
931 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  30.81 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  27.46 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  28.74 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  29.84 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  30.29 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  30.48 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.59 
 
 
698 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.39 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.22 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.74 
 
 
614 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.35 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31.32 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  31.19 
 
 
1140 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  29.72 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  28.38 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  30.66 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  29.61 
 
 
382 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.56 
 
 
355 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  26.19 
 
 
2082 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.26 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  26.78 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  27.14 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  25.95 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.53 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  25.74 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.69 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  24.9 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  26.49 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.11 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.28 
 
 
1030 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  24.63 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25 
 
 
597 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.38 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.61 
 
 
630 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  25.84 
 
 
336 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.31 
 
 
359 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  30.16 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  28.19 
 
 
742 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  27.24 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.37 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  30.16 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  30.3 
 
 
1024 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.23 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.3 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.79 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  23.93 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.3 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  24.43 
 
 
336 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.91 
 
 
652 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  30.4 
 
 
258 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.35 
 
 
1060 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  23.42 
 
 
403 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  26.01 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  24.24 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  26.01 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  23.4 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  26.28 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  22.99 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  21.97 
 
 
714 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  23.44 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  26.19 
 
 
1220 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  28.8 
 
 
681 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  25.3 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3648  BNR repeat domain protein  34.33 
 
 
299 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  30.77 
 
 
794 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>