44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3503 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  91.75 
 
 
303 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  38.06 
 
 
327 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  39.11 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  38.75 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  38.75 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  38.75 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  39.11 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  38.75 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  36.8 
 
 
334 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  36.8 
 
 
334 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.23 
 
 
325 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  34.41 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  34.41 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  34.41 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  35.48 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  29.46 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.55 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.12 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  28.24 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  31.82 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.99 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  30.41 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  30.73 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  34.29 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.86 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.24 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.89 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  27 
 
 
681 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.53 
 
 
630 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.4 
 
 
1305 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.59 
 
 
909 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  33.33 
 
 
780 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.87 
 
 
652 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  22.67 
 
 
279 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.94 
 
 
597 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.33 
 
 
999 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.96 
 
 
694 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.91 
 
 
1075 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>