56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  98.26 
 
 
288 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  44.93 
 
 
310 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  48.93 
 
 
296 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  43.64 
 
 
303 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  42.05 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  42.05 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  42.05 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  35.54 
 
 
281 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  34.6 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  34.36 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  34.89 
 
 
279 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  34.89 
 
 
279 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  34.59 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.87 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.33 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.14 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  30.55 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  30.55 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  41.21 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.2 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  28.57 
 
 
330 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  31.19 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.46 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  33.33 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  33.33 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.71 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.73 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.19 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  30.9 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  34.07 
 
 
661 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  30.3 
 
 
346 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.47 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  29.09 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.86 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  31.52 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.42 
 
 
365 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.88 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  35.58 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.24 
 
 
652 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  32.09 
 
 
344 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.11 
 
 
630 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.05 
 
 
842 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  33.98 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.33 
 
 
681 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.54 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.27 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  30.95 
 
 
742 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  40 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.19 
 
 
369 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  35.51 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  30.28 
 
 
329 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  30.59 
 
 
1026 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>