145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6491 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
345 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
345 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.01 
 
 
630 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  27.22 
 
 
681 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.82 
 
 
652 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  29.02 
 
 
608 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  31.23 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.09 
 
 
999 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.5 
 
 
1060 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  32.61 
 
 
1147 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  27.2 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25.08 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.99 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.26 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  30 
 
 
1032 aa  72.8  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.14 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.75 
 
 
1078 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.39 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.04 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
694 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.67 
 
 
1048 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.08 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  29.11 
 
 
1084 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.98 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.81 
 
 
842 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1063 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.06 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.92 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.22 
 
 
931 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  27.08 
 
 
1054 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  30.45 
 
 
913 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1082 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.94 
 
 
983 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  29.26 
 
 
1043 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.32 
 
 
1090 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  33.12 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  25.82 
 
 
911 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  24.44 
 
 
1060 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  33.12 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.57 
 
 
1021 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  23.96 
 
 
1904 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  28.04 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  25.66 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  25.6 
 
 
1305 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  30.49 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  25.17 
 
 
1083 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  26.32 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  30.86 
 
 
1220 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.47 
 
 
1044 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  36.92 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  28.75 
 
 
661 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  27.17 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.73 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  27.72 
 
 
1117 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  21.7 
 
 
952 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.25 
 
 
780 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27 
 
 
707 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  24.07 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  35.06 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  24.17 
 
 
934 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.86 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  38.54 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  38.54 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  38.54 
 
 
385 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  21.98 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  38.54 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  28.77 
 
 
906 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.4 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  25 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  27.6 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.4 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.64 
 
 
1041 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  27.82 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  26 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  21.66 
 
 
1075 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  21.98 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  22.1 
 
 
912 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.34 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  25.33 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.42 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.98 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.87 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.91 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.24 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.24 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.68 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.84 
 
 
343 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  36.46 
 
 
382 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  27.15 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  22.34 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  22.58 
 
 
350 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>