205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1546 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
652 aa  1278    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  79.15 
 
 
630 aa  938    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  33.03 
 
 
681 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  42.28 
 
 
608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.23 
 
 
694 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  28.57 
 
 
597 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.26 
 
 
1220 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.85 
 
 
780 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.77 
 
 
1078 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.86 
 
 
1063 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.19 
 
 
757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  32.76 
 
 
1054 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.11 
 
 
1084 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  28.37 
 
 
1090 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1044 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.86 
 
 
1060 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.45 
 
 
999 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.3 
 
 
1082 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  26.44 
 
 
1048 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.27 
 
 
931 aa  122  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  25.31 
 
 
1147 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.59 
 
 
909 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.03 
 
 
983 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  24.06 
 
 
1075 aa  111  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  23.86 
 
 
1305 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.56 
 
 
1041 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.01 
 
 
1032 aa  107  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  23.26 
 
 
1043 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
345 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  30.95 
 
 
362 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.4 
 
 
1060 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
345 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.76 
 
 
1021 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  24.89 
 
 
1083 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.59 
 
 
363 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.03 
 
 
912 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.93 
 
 
359 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.25 
 
 
370 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.27 
 
 
337 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26 
 
 
371 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  24.13 
 
 
952 aa  88.2  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  27.7 
 
 
371 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.37 
 
 
361 aa  87.8  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.62 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  27.45 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.3 
 
 
357 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  26.86 
 
 
373 aa  84  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.59 
 
 
357 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.77 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.77 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.55 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.98 
 
 
357 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  28.75 
 
 
934 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  27.69 
 
 
361 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.16 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.71 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.05 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.5 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.33 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  30.99 
 
 
1117 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  30.8 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.18 
 
 
366 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.37 
 
 
698 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  30.52 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.12 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.22 
 
 
357 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.76 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.35 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  43.08 
 
 
323 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  21.9 
 
 
357 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  26.22 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.79 
 
 
742 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1273  hypothetical protein  32.66 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.51 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3247  hypothetical protein  32.66 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  27.92 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0521  heme utilization protein  24.34 
 
 
723 aa  70.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160365  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  28.09 
 
 
925 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.44 
 
 
357 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.28 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  27.63 
 
 
363 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  27.38 
 
 
911 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  26.78 
 
 
913 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  34.42 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.54 
 
 
1465 aa  67.8  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.49 
 
 
707 aa  67  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  27.09 
 
 
1904 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.24 
 
 
361 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  24.65 
 
 
464 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.89 
 
 
310 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>