41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3170 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
288 aa  567  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  42.96 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  42.81 
 
 
281 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  42.51 
 
 
281 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  43.36 
 
 
279 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  43.36 
 
 
279 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  37.37 
 
 
282 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.71 
 
 
305 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  38.96 
 
 
296 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  38.96 
 
 
296 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  38.96 
 
 
296 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.24 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  40.87 
 
 
310 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  40.1 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  38.74 
 
 
288 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  34.93 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  38.58 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.3 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  25.84 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  25.84 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  27.99 
 
 
327 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.34 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  28.03 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  27.61 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  28.03 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  27.61 
 
 
323 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  25.86 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  26.97 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.99 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  37.8 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.73 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.51 
 
 
630 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.82 
 
 
652 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  27.66 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.4 
 
 
329 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  30.71 
 
 
661 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.5 
 
 
421 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1044 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  26.96 
 
 
1117 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.4 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.4 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>