55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0622 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  818    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.49 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.1 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  27.5 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.63 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  32.04 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  25.29 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  35.78 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 757 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1021 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.98 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.92 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  31.93 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  25.24 
 
 		 780 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.92 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  24.66 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  23.42 
 
 		 335 aa  46.6  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.1 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  26.05 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  30.19 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  29.31 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.15 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.58 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.07 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  27.45 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2745  hypothetical protein  23.89 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  25.64 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1032 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3022  hypothetical protein  23.33 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  32.38 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.33 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  31.03 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2762  hypothetical protein  23.89 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1515  hypothetical protein  23.11 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.97 
 
 		 1465 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  27.73 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.79 
 
 		 681 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  23.79 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 673 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3024  hypothetical protein  23.89 
 
 		 340 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1060 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  50.85 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.61 
 
 		 608 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  30.84 
 
 		 827 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>