123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4866 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  57.99 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  47.94 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  51.71 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.89 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  48.89 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  50.18 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  52.35 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  52.35 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  52.35 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  48.63 
 
 
320 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  49.67 
 
 
314 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  45.55 
 
 
324 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.71 
 
 
359 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.22 
 
 
342 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  40.78 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.68 
 
 
369 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  38.91 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.7 
 
 
365 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  38.85 
 
 
363 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  35.14 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  40.37 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  40.37 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  39.26 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  39.63 
 
 
341 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.49 
 
 
324 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  35.16 
 
 
363 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  38.13 
 
 
323 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.31 
 
 
359 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  36.95 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  34.58 
 
 
331 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  30.21 
 
 
382 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.09 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  31.58 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.83 
 
 
356 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  30.52 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  35.19 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  33.97 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  33.86 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  29.03 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  34.69 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  30.4 
 
 
336 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  30.12 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  31.74 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.93 
 
 
352 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.52 
 
 
334 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  34.66 
 
 
363 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  31.54 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  30.64 
 
 
337 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  30.21 
 
 
336 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  30.21 
 
 
336 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  30.79 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  30.72 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.01 
 
 
336 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  30.98 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  27.54 
 
 
338 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  27.54 
 
 
338 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  30.64 
 
 
342 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  27.54 
 
 
338 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  26.96 
 
 
338 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  31.58 
 
 
897 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  32.66 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  32.39 
 
 
661 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31 
 
 
336 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.37 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  38.46 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  31.28 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  31.14 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.4 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  26.67 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28.21 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.12 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.28 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  28.36 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  27.47 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  27.78 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.29 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
759 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  27.78 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  26.36 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  29.39 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  32.06 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  28.93 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  26.63 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.87 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.58 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  26.05 
 
 
698 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  27.6 
 
 
421 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  29.69 
 
 
614 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  32.23 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  26.26 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  32.79 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  31.15 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  27.49 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  32.35 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.16 
 
 
630 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  26 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  25.63 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  25.63 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  25.24 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>