17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1754 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2115  hypothetical protein  62.03 
 
 		 295 aa  351  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25.51 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.98 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2701  hypothetical protein  26.99 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3196  hypothetical protein  39.13 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102103  normal  0.212274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.78 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.75 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.27 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.58 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.29 
 
 		 630 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.41 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.41 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  32.35 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1060 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.23 
 
 		 681 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>