26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3196 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3196  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102103  normal  0.212274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2701  hypothetical protein  27.18 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1754  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2115  hypothetical protein  38.3 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.35 
 
 
630 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.78 
 
 
361 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  32.98 
 
 
1048 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.9 
 
 
597 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.5 
 
 
652 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.81 
 
 
694 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  31.31 
 
 
3794 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25.93 
 
 
608 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  30.46 
 
 
320 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2020  hypothetical protein  21.29 
 
 
344 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  35.71 
 
 
1063 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1044 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  28.21 
 
 
323 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  37.08 
 
 
409 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26.96 
 
 
362 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  29.02 
 
 
780 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.9 
 
 
371 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  30.93 
 
 
681 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  33.33 
 
 
1075 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  29.71 
 
 
365 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  20.5 
 
 
1078 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.59 
 
 
698 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>