80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1525 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  100 
 
 		 3794 aa  7694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  35.81 
 
 		 2864 aa  346  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  31.38 
 
 		 2513 aa  277  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  34.28 
 
 		 3662 aa  257  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3259  hypothetical protein  36.4 
 
 		 2149 aa  173  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1743 aa  125  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  26.68 
 
 		 2402 aa  119  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1753 aa  115  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.15 
 
 		 2262 aa  105  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1064 aa  95.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1804 aa  94.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1157 aa  89.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.21 
 
 		 1463 aa  86.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1073 aa  85.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  23.64 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.72 
 
 		 2096 aa  79.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1172 aa  79  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.83 
 
 		 2713 aa  74.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  27.15 
 
 		 1461 aa  69.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.29 
 
 		 2510 aa  69.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.34 
 
 		 6497 aa  68.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  25.38 
 
 		 809 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  26.79 
 
 		 1480 aa  64.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1600 aa  64.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.15 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1463 aa  63.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1179 aa  63.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  26.26 
 
 		 534 aa  61.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1740 aa  61.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  27.18 
 
 		 2479 aa  61.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  27.57 
 
 		 2843 aa  60.1  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.07 
 
 		 1576 aa  59.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.17 
 
 		 299 aa  58.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.19 
 
 		 3027 aa  57.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.72 
 
 		 1679 aa  57.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.35 
 
 		 5298 aa  57  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  28.79 
 
 		 2554 aa  56.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  26.34 
 
 		 368 aa  56.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1409 aa  55.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  31.41 
 
 		 329 aa  55.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.05 
 
 		 334 aa  54.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 628 aa  53.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 2558 aa  53.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.79 
 
 		 1595 aa  52.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  32.05 
 
 		 936 aa  52.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  32.05 
 
 		 936 aa  52  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  27.74 
 
 		 597 aa  52  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  26.92 
 
 		 2443 aa  52  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.79 
 
 		 1586 aa  52.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  37.84 
 
 		 363 aa  51.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 897 aa  51.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 931 aa  51.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  23.21 
 
 		 1953 aa  51.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 480 aa  50.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  24 
 
 		 661 aa  50.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1352 aa  50.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.16 
 
 		 324 aa  49.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  26.14 
 
 		 1710 aa  49.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.13 
 
 		 2290 aa  49.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  25.36 
 
 		 2652 aa  49.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  35.83 
 
 		 297 aa  49.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1159  hypothetical protein  31.82 
 
 		 336 aa  49.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.99 
 
 		 890 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.08 
 
 		 324 aa  48.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  24.39 
 
 		 2698 aa  48.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  45.65 
 
 		 583 aa  48.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 690 aa  48.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.76 
 
 		 305 aa  48.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  36.67 
 
 		 562 aa  48.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  27.05 
 
 		 2534 aa  48.5  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.73 
 
 		 455 aa  48.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1301 aa  48.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  35.9 
 
 		 520 aa  47.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.75 
 
 		 503 aa  47.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  29.69 
 
 		 614 aa  47.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  23.83 
 
 		 343 aa  47.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.46 
 
 		 312 aa  47.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3196  hypothetical protein  31.31 
 
 		 204 aa  47  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102103  normal  0.212274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.05 
 
 		 366 aa  47  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  22.39 
 
 		 874 aa  46.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>