146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1624 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  100 
 
 
1054 aa  2157    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  45.15 
 
 
1048 aa  860    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  38.62 
 
 
1043 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  51.62 
 
 
999 aa  1035    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.06 
 
 
1044 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  37.64 
 
 
1063 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  34.65 
 
 
1082 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.66 
 
 
1060 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.73 
 
 
1021 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  33.61 
 
 
1078 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  34.78 
 
 
1060 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  37.15 
 
 
931 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  31.4 
 
 
1032 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.48 
 
 
1041 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  29.24 
 
 
1075 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  33.23 
 
 
1147 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  30.31 
 
 
1090 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  32.38 
 
 
1084 aa  369  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.87 
 
 
983 aa  313  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.5 
 
 
1220 aa  184  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.22 
 
 
952 aa  184  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.73 
 
 
681 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  24.4 
 
 
1083 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.42 
 
 
912 aa  154  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.32 
 
 
694 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.76 
 
 
652 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.02 
 
 
630 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31.44 
 
 
1117 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.19 
 
 
608 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  23.83 
 
 
1750 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  27.15 
 
 
787 aa  87.8  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.55 
 
 
909 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  25.52 
 
 
942 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  26.6 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  24.61 
 
 
1904 aa  72.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.24 
 
 
780 aa  72.4  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  24.55 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.48 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  26.32 
 
 
913 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  30.2 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  26.74 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  24.55 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.65 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.46 
 
 
359 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.08 
 
 
345 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.08 
 
 
345 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  25.4 
 
 
373 aa  67  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.48 
 
 
1305 aa  66.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  23.99 
 
 
934 aa  64.7  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.04 
 
 
363 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  26.14 
 
 
925 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.61 
 
 
842 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  25.97 
 
 
836 aa  62  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.74 
 
 
371 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  21.24 
 
 
357 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  21.73 
 
 
357 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  25.42 
 
 
371 aa  59.3  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  20.79 
 
 
370 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  24.36 
 
 
935 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  21.17 
 
 
357 aa  58.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  24.44 
 
 
906 aa  58.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  23.64 
 
 
876 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  22.64 
 
 
911 aa  58.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  20.85 
 
 
350 aa  58.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
381 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.42 
 
 
320 aa  57  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  30.41 
 
 
1321 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.75 
 
 
378 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  25.84 
 
 
931 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  21.17 
 
 
357 aa  56.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  20.61 
 
 
357 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  26.45 
 
 
365 aa  56.2  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  20.91 
 
 
597 aa  56.2  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.85 
 
 
707 aa  56.2  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.75 
 
 
383 aa  56.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  20.38 
 
 
357 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  26.7 
 
 
357 aa  55.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  28.42 
 
 
367 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  24.91 
 
 
910 aa  55.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  23.68 
 
 
371 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  24.36 
 
 
382 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  22.66 
 
 
388 aa  54.7  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  22.66 
 
 
388 aa  54.7  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  24 
 
 
404 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  24 
 
 
404 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  30.06 
 
 
323 aa  54.7  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25.09 
 
 
368 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  24.84 
 
 
421 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  23.9 
 
 
385 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  20.34 
 
 
350 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  25.81 
 
 
363 aa  53.5  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  21.17 
 
 
357 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>