97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1460 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  717    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  62.92 
 
 
368 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  62.08 
 
 
377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  56.27 
 
 
362 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  54.5 
 
 
359 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  50.41 
 
 
366 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  53.23 
 
 
367 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  41.46 
 
 
373 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  40.9 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.05 
 
 
361 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  39.51 
 
 
371 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.36 
 
 
371 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.08 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  34.23 
 
 
371 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.93 
 
 
381 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  38.38 
 
 
371 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.19 
 
 
361 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  38.08 
 
 
367 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  36.99 
 
 
385 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  35.9 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  35.04 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  35.64 
 
 
382 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.68 
 
 
383 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  34.82 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  35.14 
 
 
382 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  37.17 
 
 
363 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  35.29 
 
 
382 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  35.38 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  35.38 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.5 
 
 
378 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  35.5 
 
 
369 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  37.09 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  33.42 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  33.42 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  36.16 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  33.87 
 
 
365 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  33.68 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  32.51 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.25 
 
 
681 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.69 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.52 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.8 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25.9 
 
 
608 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.85 
 
 
630 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  20.59 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.31 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  23.62 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  20.27 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  20.27 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  23.62 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.31 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  20.39 
 
 
597 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.06 
 
 
1083 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  28.7 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  20.53 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.25 
 
 
694 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  23.93 
 
 
350 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  21.36 
 
 
357 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.31 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.01 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.31 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.31 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  30.05 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  21.02 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  25.1 
 
 
347 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.8 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.01 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  23.44 
 
 
361 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  23.44 
 
 
361 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  23.44 
 
 
361 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  27.11 
 
 
1060 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.3 
 
 
1082 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  30.71 
 
 
952 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.87 
 
 
931 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  30.06 
 
 
1043 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.93 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.93 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  23.4 
 
 
873 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  21.3 
 
 
698 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.36 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  24.22 
 
 
787 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.35 
 
 
1060 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.66 
 
 
999 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1063 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  24.74 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.5 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.86 
 
 
1041 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.38 
 
 
1220 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  23.79 
 
 
1054 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  27.27 
 
 
1117 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.93 
 
 
661 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.34 
 
 
1078 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>