42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1115 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1078    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  61.54 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1113  hypothetical protein  67.72 
 
 		 300 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  58.59 
 
 		 1191 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  39.06 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  37.59 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.7 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.66 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  30.71 
 
 		 912 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1117 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  28.36 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26.81 
 
 		 362 aa  52  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1048 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1147 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.08 
 
 		 1305 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  25.17 
 
 		 343 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1078 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  32.26 
 
 		 1083 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 931 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  25.71 
 
 		 952 aa  47.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  29.1 
 
 		 1084 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  31.36 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.48 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.13 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 983 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  28.12 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  28.12 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  39.24 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.37 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.72 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1063 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  28.12 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  30.39 
 
 		 942 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 999 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  30.51 
 
 		 357 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 757 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1090 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  32.67 
 
 		 913 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1075 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>