57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5064 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 853 aa  1729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  41.04 
 
 		 792 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  44.41 
 
 		 743 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  43.1 
 
 		 990 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  41.67 
 
 		 1750 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  35.35 
 
 		 831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1062 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  33 
 
 		 3602 aa  104  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  32.92 
 
 		 859 aa  88.6  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.1 
 
 		 3191 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  45.61 
 
 		 266 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  38.94 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  38.61 
 
 		 999 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 1989 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  28.04 
 
 		 351 aa  62  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  26.56 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  29.6 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.59 
 
 		 1526 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  39.77 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  43.42 
 
 		 3507 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  37.78 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  36.99 
 
 		 1042 aa  57.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  33.59 
 
 		 4433 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  44.3 
 
 		 861 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 1377 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  26.14 
 
 		 334 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1294 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  28.95 
 
 		 779 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 		 2573 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.85 
 
 		 3324 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  37.36 
 
 		 480 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  27.65 
 
 		 983 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  26.45 
 
 		 1293 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  31.82 
 
 		 836 aa  52.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  37.7 
 
 		 907 aa  51.2  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2489 aa  51.2  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0774  hypothetical protein  31.15 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.891032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.31 
 
 		 1343 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 995 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  32.5 
 
 		 478 aa  48.5  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  34.67 
 
 		 2334 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  22.37 
 
 		 2490 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  25.07 
 
 		 601 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  36.76 
 
 		 2068 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  36.28 
 
 		 301 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  25.37 
 
 		 1533 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1202 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2487 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.89 
 
 		 3921 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  31.31 
 
 		 409 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1227 aa  44.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  32.53 
 
 		 490 aa  44.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  34.94 
 
 		 3920 aa  44.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  36.45 
 
 		 1363 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  29.84 
 
 		 1973 aa  44.3  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>