58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2276 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  100 
 
 		 644 aa  1253    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  45.52 
 
 		 3602 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1327  hypothetical protein  35.97 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178227  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.91 
 
 		 3419 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.57 
 
 		 3324 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3253  hypothetical protein  44.58 
 
 		 376 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00034855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  38.32 
 
 		 1093 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.46 
 
 		 2487 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.54 
 
 		 3299 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.8 
 
 		 3298 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.7 
 
 		 3537 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.64 
 
 		 3535 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  40.98 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  40.6 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  48.39 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  35.19 
 
 		 990 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  27.21 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  29.81 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  37.78 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.14 
 
 		 3191 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  36.19 
 
 		 3921 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.17 
 
 		 744 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 		 835 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  31.97 
 
 		 886 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 		 775 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1999  Proprotein convertase P  28.12 
 
 		 209 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  35.38 
 
 		 1750 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0345  proprotein convertase P  23.33 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  38.46 
 
 		 1293 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  37.29 
 
 		 1989 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  33.33 
 
 		 938 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.26 
 
 		 4896 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 835 aa  50.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 		 836 aa  50.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  27.62 
 
 		 574 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  32.43 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.21 
 
 		 907 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  27.44 
 
 		 1151 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  29.09 
 
 		 840 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1325  hypothetical protein  40.54 
 
 		 333 aa  48.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183537  normal  0.158275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  34.44 
 
 		 775 aa  48.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2005 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  27.45 
 
 		 768 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 2573 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1227 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  36.17 
 
 		 983 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0344  peptidase domain-containing protein  24.36 
 
 		 716 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.598712  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  28.57 
 
 		 794 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1072  hypothetical protein  44.9 
 
 		 725 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  32.81 
 
 		 831 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  35.25 
 
 		 587 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  38.46 
 
 		 827 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  37.14 
 
 		 2886 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  32.5 
 
 		 951 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.53 
 
 		 823 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  38.75 
 
 		 2772 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>