55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  100 
 
 		 808 aa  1549    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  51.31 
 
 		 904 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  45.74 
 
 		 818 aa  212  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  36.7 
 
 		 910 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  33.75 
 
 		 2024 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  32.42 
 
 		 3834 aa  171  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  38.52 
 
 		 560 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  38.49 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  37.91 
 
 		 637 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  34.21 
 
 		 1288 aa  99.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  40.88 
 
 		 577 aa  94.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  31.54 
 
 		 587 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  31.24 
 
 		 2345 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  32.52 
 
 		 704 aa  84.7  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  32.36 
 
 		 4120 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.42 
 
 		 1554 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  35.47 
 
 		 316 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  34.5 
 
 		 861 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.66 
 
 		 3608 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  35.53 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.31 
 
 		 3619 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.9 
 
 		 3619 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1329 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.64 
 
 		 1657 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  22.73 
 
 		 2713 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  31.18 
 
 		 2318 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1099  hypothetical protein  47.76 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  41.57 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 		 1750 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1976 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.97 
 
 		 3793 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11935  hypothetical protein  37.8 
 
 		 156 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1969 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.64 
 
 		 1607 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  46.03 
 
 		 848 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.22 
 
 		 2807 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.78 
 
 		 1507 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.2 
 
 		 1345 aa  48.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.22 
 
 		 2454 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.12 
 
 		 747 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.22 
 
 		 2421 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  27.68 
 
 		 1108 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.71 
 
 		 14944 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.1 
 
 		 1343 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.74 
 
 		 2950 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  27.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.77 
 
 		 2367 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.77 
 
 		 2411 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1068  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  44.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5265  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.4 
 
 		 1079 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5557  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5176  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1289 aa  44.3  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>