19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0804 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  100 
 
 
946 aa  1878    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  34.63 
 
 
948 aa  383  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  36.59 
 
 
3851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.04 
 
 
3682 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  29.73 
 
 
1313 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  33.48 
 
 
1245 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.82 
 
 
4071 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 
3324 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  32.29 
 
 
392 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  25.82 
 
 
846 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  29.11 
 
 
554 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
1332 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.54 
 
 
3602 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.52 
 
 
2833 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  34.67 
 
 
691 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.57 
 
 
1969 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.24 
 
 
3562 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  32.53 
 
 
884 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  24.71 
 
 
938 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>