180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3716 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1918 aa  3845    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  52.52 
 
 		 912 aa  525  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.42 
 
 		 884 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.78 
 
 		 532 aa  328  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  40.43 
 
 		 694 aa  320  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.57 
 
 		 358 aa  295  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.27 
 
 		 328 aa  243  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.59 
 
 		 742 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  42.09 
 
 		 291 aa  216  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.11 
 
 		 306 aa  196  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 		 1321 aa  196  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.11 
 
 		 315 aa  193  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  38.6 
 
 		 328 aa  186  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  39.58 
 
 		 883 aa  186  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40.77 
 
 		 503 aa  183  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  32.01 
 
 		 641 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 642 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  39.57 
 
 		 301 aa  175  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  38.75 
 
 		 276 aa  175  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.26 
 
 		 1426 aa  165  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.75 
 
 		 1694 aa  163  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 1290 aa  161  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  38.04 
 
 		 279 aa  161  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  39.42 
 
 		 286 aa  160  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  38.77 
 
 		 274 aa  159  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.79 
 
 		 389 aa  153  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.64 
 
 		 627 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  34.68 
 
 		 1028 aa  149  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  37.12 
 
 		 330 aa  146  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36.26 
 
 		 286 aa  146  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  37.73 
 
 		 291 aa  146  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  35.69 
 
 		 469 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 		 1332 aa  144  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.71 
 
 		 383 aa  144  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.45 
 
 		 633 aa  142  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 409 aa  141  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 		 556 aa  141  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  36.59 
 
 		 289 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 423 aa  135  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.9 
 
 		 283 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.99 
 
 		 281 aa  132  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.56 
 
 		 282 aa  127  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  40.53 
 
 		 731 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03791  glycosyl hydrolase, family 16  35.87 
 
 		 437 aa  124  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000024164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.04 
 
 		 547 aa  122  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.79 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.34 
 
 		 569 aa  119  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.13 
 
 		 252 aa  118  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.27 
 
 		 426 aa  116  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.43 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.53 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34.07 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.42 
 
 		 819 aa  112  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  29.51 
 
 		 313 aa  111  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 		 384 aa  109  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  32.73 
 
 		 1441 aa  108  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 752 aa  105  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 346 aa  104  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.57 
 
 		 1059 aa  103  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  32.33 
 
 		 319 aa  102  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  31.51 
 
 		 588 aa  101  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  30.87 
 
 		 405 aa  98.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.4 
 
 		 271 aa  97.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.53 
 
 		 286 aa  94.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.68 
 
 		 470 aa  87  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.84 
 
 		 477 aa  86.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  33.91 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.31 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 907 aa  85.9  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  26.26 
 
 		 277 aa  85.5  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 320 aa  85.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.8 
 
 		 269 aa  83.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  30.53 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  27.05 
 
 		 275 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 608 aa  81.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  29.37 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  26.8 
 
 		 295 aa  78.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 449 aa  77.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  29.57 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.37 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 306 aa  73.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  47.37 
 
 		 1707 aa  73.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  26.23 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 		 492 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  56.72 
 
 		 401 aa  71.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 427 aa  72  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 465 aa  70.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  28.33 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  57.38 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  45.57 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  33.11 
 
 		 1414 aa  68.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  51.25 
 
 		 319 aa  67.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 380 aa  68.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  27.92 
 
 		 539 aa  67.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  27.72 
 
 		 318 aa  67.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.89 
 
 		 915 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2433  hypothetical protein  28.63 
 
 		 533 aa  67.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.4 
 
 		 927 aa  67  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>