34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0555 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  100 
 
 		 1426 aa  2831    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  47.29 
 
 		 731 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  40.76 
 
 		 783 aa  198  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  46.08 
 
 		 956 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  36.26 
 
 		 1918 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.96 
 
 		 884 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03791  glycosyl hydrolase, family 16  38.5 
 
 		 437 aa  117  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000024164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.31 
 
 		 912 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1130  PKD domain containing protein  42.04 
 
 		 514 aa  115  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  35.29 
 
 		 599 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2433  hypothetical protein  39.87 
 
 		 533 aa  102  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  35.65 
 
 		 604 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  31.93 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  31.18 
 
 		 268 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.54 
 
 		 1107 aa  63.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  27.46 
 
 		 491 aa  61.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  29.63 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 589 aa  58.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 743 aa  57.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  27.49 
 
 		 272 aa  56.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  27.81 
 
 		 475 aa  55.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  36.11 
 
 		 554 aa  52.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  33.75 
 
 		 787 aa  52.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  26.46 
 
 		 773 aa  52  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  29.52 
 
 		 596 aa  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 611 aa  50.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  29.44 
 
 		 380 aa  48.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.87 
 
 		 742 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  32.28 
 
 		 772 aa  46.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  36.78 
 
 		 588 aa  47  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  32 
 
 		 545 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  24.73 
 
 		 773 aa  45.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>