138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0109 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  55.52 
 
 		 503 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  55.04 
 
 		 274 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  58.85 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  58.26 
 
 		 286 aa  298  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  56.15 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  56.25 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  48.72 
 
 		 469 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  47.69 
 
 		 330 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  47.77 
 
 		 556 aa  222  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 		 1321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  44.96 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  47.74 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  43.94 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.63 
 
 		 358 aa  204  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  46.25 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  45.34 
 
 		 423 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  38.96 
 
 		 694 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  43.46 
 
 		 641 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  43.46 
 
 		 642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.7 
 
 		 627 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.66 
 
 		 884 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  42.03 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  41.45 
 
 		 389 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.07 
 
 		 532 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  41.83 
 
 		 883 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  44.26 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.95 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 		 328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.34 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.41 
 
 		 1290 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.19 
 
 		 912 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  39.07 
 
 		 1918 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.59 
 
 		 1694 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.67 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.72 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  38.67 
 
 		 1028 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.25 
 
 		 633 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.58 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  39.2 
 
 		 426 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 		 742 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  40.41 
 
 		 409 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.77 
 
 		 1332 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40 
 
 		 569 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.61 
 
 		 547 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.35 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.43 
 
 		 384 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  40.15 
 
 		 588 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.82 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  37.74 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  35.19 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40 
 
 		 1441 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  35.23 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.23 
 
 		 1059 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.95 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.02 
 
 		 752 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.97 
 
 		 405 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.09 
 
 		 819 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  38.17 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 427 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 394 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  36.95 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.05 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 608 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 907 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.48 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.68 
 
 		 475 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.49 
 
 		 479 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  32.02 
 
 		 467 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  36.14 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  33.45 
 
 		 479 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  28.67 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 465 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  32.61 
 
 		 539 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.72 
 
 		 1707 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  32.18 
 
 		 477 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 470 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.25 
 
 		 915 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.82 
 
 		 722 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  30.36 
 
 		 464 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  33.87 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  31.75 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  29.45 
 
 		 469 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.3 
 
 		 639 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  31.71 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  28.19 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.22 
 
 		 1007 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  26.73 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  26.73 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  29.27 
 
 		 842 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>