125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6434 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  57.98 
 
 		 275 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  46.69 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  37.12 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.68 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 556 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.25 
 
 		 389 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  34.56 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.96 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  39.08 
 
 		 588 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.02 
 
 		 409 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  37.63 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  34.77 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  35.36 
 
 		 642 aa  135  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  35.36 
 
 		 641 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.23 
 
 		 1290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 1321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.88 
 
 		 358 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.45 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35 
 
 		 547 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.84 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  34.98 
 
 		 883 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  35.94 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 694 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 469 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.5 
 
 		 1059 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.85 
 
 		 633 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.45 
 
 		 532 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  32.23 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  29.97 
 
 		 503 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.18 
 
 		 627 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  31.21 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  34.35 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.06 
 
 		 819 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 1332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.71 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.94 
 
 		 742 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  29.31 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.56 
 
 		 1694 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.21 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.72 
 
 		 426 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.24 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  33.21 
 
 		 1441 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.97 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.95 
 
 		 569 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.61 
 
 		 884 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.77 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.15 
 
 		 912 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.75 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  29.53 
 
 		 1918 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 394 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 238 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.45 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.22 
 
 		 467 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 449 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  27.69 
 
 		 475 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.04 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  24.83 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  29.2 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.73 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 752 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  26.63 
 
 		 1707 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  31.49 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  27.84 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.41 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.71 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  26.4 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  23.9 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  27.21 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  27.53 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  27.87 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  26.07 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  27.68 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.12 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  32.24 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  26.38 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  25.12 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  26.14 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  29.68 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  25.95 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  26.07 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  29.48 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  27.22 
 
 		 691 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.21 
 
 		 446 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>