116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4793 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
320 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  44.53 
 
 
907 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  42.91 
 
 
608 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 
465 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  37.68 
 
 
306 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  33.59 
 
 
475 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  39 
 
 
686 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 
1321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  36.27 
 
 
883 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 
642 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 
641 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.92 
 
 
627 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.63 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.94 
 
 
426 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  32.85 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.46 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  36.95 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  36.69 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.55 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.74 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.78 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  35.88 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.46 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 
301 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
286 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  36 
 
 
588 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  33.77 
 
 
279 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35 
 
 
1290 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  33.83 
 
 
328 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  36.72 
 
 
384 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 
694 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.68 
 
 
252 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.83 
 
 
633 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.88 
 
 
358 aa  99  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.13 
 
 
742 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  32.93 
 
 
1028 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.46 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  28.57 
 
 
330 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 
1332 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  37.7 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.85 
 
 
532 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.64 
 
 
569 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 
284 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.72 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.9 
 
 
1694 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.96 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.24 
 
 
884 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.84 
 
 
912 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.14 
 
 
547 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  29.03 
 
 
1918 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 
556 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
238 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.81 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.62 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  36.6 
 
 
842 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.65 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.8 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  31.58 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.61 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.42 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  33.68 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  31.06 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  30.11 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  31.82 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  31.03 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  31.17 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  31.35 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  29.44 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  26.99 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.85 
 
 
819 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.57 
 
 
1059 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 
752 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  29 
 
 
691 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25.29 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.14 
 
 
1441 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.38 
 
 
477 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  34.06 
 
 
486 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  29.53 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  30.71 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
449 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
191 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.33 
 
 
1007 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  29.07 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  30 
 
 
467 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  28 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  23.67 
 
 
1707 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  27.42 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  25.87 
 
 
446 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  31.58 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>