201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  58.44 
 
 
999 aa  1142    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1007 aa  2031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.18 
 
 
929 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  57.51 
 
 
469 aa  326  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.66 
 
 
639 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  53.26 
 
 
464 aa  282  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  50.55 
 
 
479 aa  266  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  51.29 
 
 
479 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  51.67 
 
 
446 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  48.72 
 
 
470 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  85.09 
 
 
755 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  47.25 
 
 
318 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.79 
 
 
815 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  79.03 
 
 
962 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  40.86 
 
 
539 aa  193  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  37.31 
 
 
588 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  69.57 
 
 
987 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.76 
 
 
674 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  58.75 
 
 
578 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  75 
 
 
1158 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  57.74 
 
 
581 aa  173  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  55.11 
 
 
433 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 
752 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  54.84 
 
 
850 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  61.87 
 
 
449 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1366  hypothetical protein  28.26 
 
 
411 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.24 
 
 
722 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  55.04 
 
 
637 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.29 
 
 
940 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  34.66 
 
 
388 aa  142  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.62 
 
 
756 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  62.2 
 
 
578 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  51.43 
 
 
571 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.28 
 
 
819 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.56 
 
 
1321 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  52.71 
 
 
1070 aa  131  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.79 
 
 
953 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  54.68 
 
 
452 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  51.2 
 
 
1441 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
361 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.16 
 
 
1581 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  55.46 
 
 
1338 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  47.01 
 
 
1059 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  47.2 
 
 
392 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.06 
 
 
971 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  49.61 
 
 
879 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  51.2 
 
 
1103 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  44.44 
 
 
732 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  49.6 
 
 
4013 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.8 
 
 
558 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.33 
 
 
801 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.96 
 
 
1117 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.4 
 
 
289 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.55 
 
 
1564 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
915 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3041  putative secreted protein  25.46 
 
 
425 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0311807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.93 
 
 
729 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.27 
 
 
695 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.16 
 
 
1059 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1418  hypothetical protein  24.29 
 
 
408 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0436845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3262  hypothetical protein  24.83 
 
 
454 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.18 
 
 
283 aa  104  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.55 
 
 
423 aa  104  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.01 
 
 
984 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.41 
 
 
1362 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.11 
 
 
820 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.27 
 
 
383 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
426 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  29.28 
 
 
883 aa  94.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  39.6 
 
 
1471 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 
1332 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3129  putative secreted protein  24.88 
 
 
435 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.433942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.28 
 
 
633 aa  92.8  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.9 
 
 
480 aa  92.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.78 
 
 
472 aa  91.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.78 
 
 
472 aa  91.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  46.02 
 
 
487 aa  91.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.02 
 
 
487 aa  91.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  31.85 
 
 
389 aa  91.3  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  50 
 
 
470 aa  90.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 
556 aa  90.1  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 
641 aa  90.1  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.18 
 
 
471 aa  90.1  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 
642 aa  90.1  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 
384 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.27 
 
 
1139 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  33.2 
 
 
291 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  31.65 
 
 
286 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  32.26 
 
 
274 aa  88.2  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  41.48 
 
 
1028 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.06 
 
 
261 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.12 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.26 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  31.37 
 
 
279 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  49.11 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.26 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.18 
 
 
884 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.36 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  31.82 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 
260 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>