18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1418 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1418  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  808    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0436845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1366  hypothetical protein  40.97 
 
 
411 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3262  hypothetical protein  28.37 
 
 
454 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3129  putative secreted protein  28.72 
 
 
435 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.433942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3041  putative secreted protein  25.13 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0311807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.4 
 
 
1007 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.04 
 
 
929 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  25.13 
 
 
999 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1014  hypothetical protein  25.17 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
924 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.76 
 
 
717 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
806 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  30.97 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  25.43 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.09 
 
 
563 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.85 
 
 
928 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.63 
 
 
564 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  25.65 
 
 
568 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>