39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3041 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3041  putative secreted protein  100 
 
 		 425 aa  891    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0311807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3129  putative secreted protein  42.69 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.433942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3262  hypothetical protein  31.84 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1366  hypothetical protein  29.44 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  27.79 
 
 		 999 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1418  hypothetical protein  25.21 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0436845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.46 
 
 		 1007 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.57 
 
 		 929 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.94 
 
 		 986 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 924 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.39 
 
 		 577 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.71 
 
 		 598 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  25.31 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.88 
 
 		 882 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 919 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 888 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  21.66 
 
 		 564 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.95 
 
 		 601 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  29.29 
 
 		 596 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  25.77 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.44 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.38 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.17 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.6 
 
 		 1084 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 1084 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.14 
 
 		 1023 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  23.32 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  27.33 
 
 		 644 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  22.09 
 
 		 603 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.77 
 
 		 1036 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.09 
 
 		 598 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  25.97 
 
 		 588 aa  43.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>