37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2181 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 
568 aa  1160    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  25.59 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  26.64 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0285  glycoside hydrolase family 42 protein  24.2 
 
 
383 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696362  hitchhiker  0.00613688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
924 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  24.03 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  23.4 
 
 
640 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  26.38 
 
 
600 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  22.22 
 
 
354 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  21.88 
 
 
390 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  20.99 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  20.4 
 
 
388 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  22.31 
 
 
357 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  27.22 
 
 
415 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  22.31 
 
 
357 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  22.09 
 
 
362 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1366  hypothetical protein  25.86 
 
 
411 aa  50.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  27.61 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  21.11 
 
 
382 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  20.73 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  20.73 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  20.73 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  26.5 
 
 
669 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.12 
 
 
980 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4604  hypothetical protein  26.19 
 
 
173 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  0.397597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  21.74 
 
 
382 aa  47  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  28.79 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  22.09 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 
627 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1014  hypothetical protein  23.81 
 
 
407 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  22.22 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  23.86 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  23.42 
 
 
414 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  25.64 
 
 
667 aa  43.5  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>