27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0780 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  99.72 
 
 		 357 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  68.84 
 
 		 356 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  66.86 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  38.29 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  39.77 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  37.32 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  35.51 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  36.13 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  36.26 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  36.97 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  34.94 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  38.03 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  35.47 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  34.93 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  34.93 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  34.93 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  34.84 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  34.84 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  34.84 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  33.43 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  34.27 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  29.97 
 
 		 447 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  25.86 
 
 		 772 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  29.44 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  22.31 
 
 		 568 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 627 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>