24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3479 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  26.13 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  27.93 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  27.91 
 
 		 772 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  26.18 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  26.07 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  27.9 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  29.44 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  29.44 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  25.86 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  29.74 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  27.54 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  29.74 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  29.74 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  27.46 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  28.51 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  24.55 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  27.59 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  25.46 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  26.32 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  25.46 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  25.46 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  33.03 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.321181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>