28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3082 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  56.83 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  58.94 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  56.98 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  55.18 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  51.81 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  51.26 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  51.26 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  51.54 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  51.68 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  51.68 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  50.84 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  51.68 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  49.03 
 
 		 379 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  50.14 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  44.68 
 
 		 352 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  44.79 
 
 		 353 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  44.04 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  37.36 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  36.13 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  36.13 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  34.71 
 
 		 354 aa  230  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  35.07 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  30.99 
 
 		 772 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  27.9 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  21.11 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 627 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  19.47 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>