26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1465 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  65.71 
 
 		 362 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  60.63 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  48.88 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  47.9 
 
 		 382 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  44.79 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  44.25 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  43.65 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  45.61 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  45.61 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  45.61 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  42.7 
 
 		 383 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  41.42 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  43.42 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  42.6 
 
 		 414 aa  288  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  42.36 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  42.36 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  42.36 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  35.51 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  35.51 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  35.41 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  34.65 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  33.78 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  29.52 
 
 		 772 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  26.13 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  20.48 
 
 		 425 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>